《風色幻想6》采用的是即時策略的戰斗方式，玩家在戰斗過程中可以有針對性的調整隊伍人員的走位，避免被集火秒掉，同時也可以控制角色集火敵方角色，有效控制對方有生力量。

滑鼠操作方式

『滑鼠左鍵』：決定

『滑鼠右鍵』：取消 / 上一步 / 關閉指令選單 / 離開狀態、據點介面 / 進入人物狀態畫面（在戰斗中，指令選單需關閉）

『滑鼠中鍵』：鏡頭調整功能（按著滑鼠中鍵不放，接著移動滑鼠游標時，鏡頭 就會跟著游標調整）

『滑鼠滾輪』：鏡頭拉遠拉近（滾輪向前為鏡頭拉近，滾輪向后為鏡頭拉遠）/ 滾動列表（在清單中）

一般滾輪滑鼠的中鍵就等於滑鼠的滾輪（玩家可以按下去試試看），另外部分高階滑鼠會有屬於自己的滑鼠按鍵定義精靈，在執行游戲前請確認按鍵精靈中的滑鼠滾輪功能是否為中鍵功能

鍵盤操作方式

『ESC』鍵：進入人物狀態畫面（限戰斗中且戰斗指令選單需關閉）

『F1』鍵：抓取游戲畫面，圖片會存放在游戲目錄下的『ScreenShot』資料夾中

『F6』鍵：開啟 / 關閉 戰場地板格線標示

『Tab』鍵：當戰斗指令選單關閉時，按下此鍵會開啟目前行動中的我方角色之指令選單

『方向鍵』（非九宮格）：移動戰場地板游標

『Ctrl』鍵：劇情對話快速播放

小鍵盤

『NUM 7』鍵（筆記型電腦的『&』鍵）：鏡頭上旋

『NUM 1』鍵（筆記型電腦的『J』鍵）：鏡頭下旋

『NUM 8』鍵（筆記型電腦的『*』鍵）：鏡頭平移向前

『NUM 2』鍵（筆記型電腦的『K』鍵）：鏡頭平移向后

『NUM 4』鍵（筆記型電腦的『U』鍵）：鏡頭平移向左

『NUM 6』鍵（筆記型電腦的『O』鍵）：鏡頭平移向右

『NUM 5』鍵（筆記型電腦的『I』鍵）：鏡頭歸位

『NUM 9』鍵（筆記型電腦的『(』鍵）：鏡頭垂直向上

『NUM 3』鍵（筆記型電腦的『L』鍵）：鏡頭垂直向下

『NUM 0』鍵（筆記型電腦的『M』鍵）：鏡頭左旋

『NUM .』鍵：鏡頭右旋

『NUM -』鍵：鏡頭拉遠

『NUM +』鍵：鏡頭拉近

『Fn』鍵（限筆記型電腦）：功能切換鈕